实验术语与待补关键词
使用方法
后续在会议、邮件、实验报告或项目讨论中遇到不熟悉的词,直接追加到“待补充”表格。本知识库随后按以下结构补齐:
一句话定义
→ 在研发流程中的位置
→ 实验输入与输出
→ 关键质量指标
→ 常见误解/失败模式
→ 与CADD/AIDD的连接
已加入关键词
1. 质粒(plasmid)
质粒是可在宿主细胞中复制或表达外源基因的 DNA 载体。对重组抗体而言,常见关注点包括:
- 重链和轻链是两个质粒还是同一双顺反子/多表达盒载体;
- promoter、signal peptide、poly(A)、selection marker、origin of replication;
- VH/VL、恒定区、Fc mutation 和标签是否正确;
- 密码子优化、序列验证、质粒浓度、纯度和内毒素;
- transfection-grade 与普通克隆级质粒的区别。
研发链条:
amino-acid sequence
→ codon optimization
→ gene synthesis
→ cloning into expression plasmid
→ sequence verification
→ transfection into HEK/CHO
→ antibody expression
2. CRS(cytokine release syndrome)
CRS 是免疫细胞被强烈激活后产生的全身性炎症综合征,可见于 TCE、CAR-T 等治疗。它不等于“检测到某个 cytokine 升高”,也不等同于体外 cytokine release assay。
需要区分:
- 体外 cytokine release assay:风险识别模型;
- 动物 cytokine profile:物种和模型相关的体内信号;
- 临床 CRS:综合症状、生命体征、器官影响和实验室指标后的临床判断与分级。
对 TCE 项目需联动理解 target density、CD3 arm、价态、Fc、剂量、给药速度、step-up dosing、肿瘤负荷和个体免疫差异。
3. 杂交瘤(hybridoma)
杂交瘤技术把免疫动物的抗体产生 B 细胞与可持续增殖的骨髓瘤细胞融合,经过选择、筛选和单克隆化,获得稳定分泌某一抗体的细胞株。
典型链条:
antigen preparation
→ animal immunization
→ B-cell isolation
→ fusion
→ HAT selection
→ supernatant screening
→ subcloning/monoclonality
→ sequencing
→ recombinant expression and validation
优势:成熟、可直接获得抗体分泌克隆。局限:通常周期较长,受免疫耐受和动物免疫反应影响;得到候选后仍需测序和重组确认。
4. 噬菌体展示库(phage display library)
把 scFv、Fab 或 VHH 等抗体片段展示在噬菌体表面,同时噬菌体内部携带其编码 DNA,从而建立 genotype–phenotype linkage。
关键概念:
- naïve、immune、synthetic/semi-synthetic library;
- library size、insert rate、sequence diversity 和 developability bias;
- solid-phase、solution、cell-based 或 negative selection;
- panning、enrichment、clone screening 和 sequencing;
- 展示片段命中不等于转成全长 IgG 后仍保持相同性质。
5. 单细胞测序与单 B 细胞抗体发现
“单细胞测序”是大类技术,包括 scRNA-seq、单细胞 V(D)J/BCR/TCR 测序等。抗体发现重点通常是:
- 获得单个 B 细胞天然配对的 VH/VL;
- 结合 antigen-specific sorting、memory B/plasma B 表型;
- clonotype、somatic hypermutation、isotype 和 lineage;
- 序列合成、重组表达和功能验证。
单细胞序列本身不能证明抗体有活性;最终仍需要表达、纯化、结合和功能实验。
三种抗体发现路线对比
| 维度 | 杂交瘤 | 噬菌体展示 | 单 B 细胞 |
|---|---|---|---|
| 起点 | 免疫动物 B 细胞 | 已有或新建展示文库 | 免疫动物/患者/供者 B 细胞 |
| VH/VL 配对 | 天然 | 取决于文库构建,常为组合配对 | 天然配对 |
| 是否依赖免疫 | 通常是 | 可免疫也可 naïve/synthetic | 通常需要合适 B 细胞来源 |
| 主要选择压力 | 动物免疫+体外筛选 | 多轮体外 panning | 抗原特异单细胞筛选 |
| 常见优势 | 成熟、稳定克隆 | 可控筛选、库容量大 | 快、保留天然配对 |
| 常见局限 | 周期长、耐受 | display/IgG 转换偏差、库偏倚 | 样本和分选质量、序列后仍需验证 |
第 1 批:Assay 分类与读数语言
每条按紧凑六段式:定义 → 研发位置 → 关键指标 → 常见误解 → CADD 连接。
6. EC50(半数有效浓度)
引起 50% 最大效应的浓度。剂量—反应曲线的核心横坐标参数。
- 位置:所有剂量反应型 assay(结合、杀伤、报告基因);
- 关键指标:依赖 Emax 是否达到平台、拟合模型与权重;跨日 SD 用 log EC50;
- 误解:把 EC50 当"亲和力"——它受靶密度、效应细胞与孵育时间影响,不是分子常数;
- CADD 连接:设计迭代中最常用的排序参数,但必须与 Emax 联读。
7. Emax(最大效应)
剂量—反应曲线的平台高度。
- 位置:与 EC50 同一拟合;
- 关键指标:是否真达到平台(顶部浓度够不够);
- 误解:Emax 低被归为"平台差异"——可能是样品失活或机制性天花板;
- CADD 连接:Emax 决定体内暴露覆盖目标(EC90)的推算,直接影响 PK/PD 设计。
8. Hill slope(希尔系数)
4PL 曲线的斜率参数,反映剂量—效应陡峭程度。
- 位置:曲线拟合第四参数;
- 关键指标:典型值≈1;显著偏离提示协同/正协同结合或多种机制混杂;
- 误解:固定 slope=1 省事——掩盖双价结合与机制混杂;
- CADD 连接:slope 异常陡(>1.5)常见于二价/多价分子,是 avidity 的曲线签名。
9. 4PL/5PL(四/五参数逻辑模型)
标准剂量—反应拟合方程:4PL = 底、顶、EC50、slope;5PL 增加不对称参数。
- 位置:所有浓度梯度数据的分析层;
- 关键指标:残差分布、权重方式(通常 1/y²)、自由度;
- 误解:R² 高即模型对——权重不当会让 EC50 系统性偏移;
- CADD 连接:机器学习打分与实验 EC50 对齐时,必须先统一拟合方法。
10. KD(平衡解离常数)
kon 与 koff 之比,表征结合强度:KD = koff/kon。
- 位置:SPR/BLI 动力学拟合输出;
- 关键指标:单位 nM/pM;小=结合强;
- 误解:KD 完全描述了结合——同一 KD 可由快 kon 快 koff 或慢 kon 慢 koff 组成,体内行为完全不同;
- CADD 连接:结构与计算模型预测的首要靶参数。
11. kon / koff(结合/解离速率常数)
kon(ka):形成复合物的速率;koff(kd):解离速率。
- 位置:动力学实验的两个独立测量;
- 关键指标:koff 决定 residence time(=1/koff);
- 误解:只报 KD 不报速率——对内吞型靶点/快速解离再结合场景,koff 更有预测力;
- CADD 连接:koff 与结合界面热点残基的关系是计算突变设计的核心反馈。
12. Residence time(驻留时间)
1/koff,配体停留于靶点的平均时间。
- 位置:动力学解释层;
- 关键指标:内吞型靶点(如 TCE 靶抗原)中,长驻留可能促进降解而非信号;
- 误解:越长越好——慢 koff 可能带来 avidity 驱动的脱靶滞留;
- CADD 连接:区分"结合快"与"停留久"是理性设计亲和力成熟的前提。
13. Avidity(亲合力)
多价分子同时结合多个表位产生的表观结合增强。
- 位置:双抗/多抗、细胞表面多价抗原场景;
- 关键指标:表观亲和力可比单体 KD 强几个数量级;
- 误解:把 avidity 增强当作单体亲和力提升写入分子档案;
- CADD 连接:几何(臂长、间距)设计直接调节 avidity——这正是结构设计的用武之地。
14. Z' factor( assay 质量系数)
阳性与阴性对照信号窗与变异的比值,衡量 assay 可区分能力。
- 位置:assay 建立期与日常质控;
- 关键指标:>0.5 优;0–0.5 边缘;<0 不可用;
- 误解:Z' 好等于任何差异都能测——它只说明对照窗可用,小差异仍受精密度限制;
- CADD 连接:与机器学习分类的 ROC 类比——先有区分窗,再谈排序。
15. CV%(变异系数)
SD/均值×100%,相对变异度量。
- 位置:精密度评估(板内、板间、日间);
- 关键指标:技术 CV(复孔)≠ 生物学 CV(独立实验);
- 误解:复孔 CV 小即结果可靠——日间漂移常常是复孔 CV 的数倍;
- CADD 连接:模型预测与实验对比时的"可检出差异"由 CV 决定,而非愿望。
16. S/B(信号背景比)
阳性信号与背景/空白之比。
- 位置:assay 建立的最低可用标准之一;
- 关键指标:与 S/N(信噪比)不同——S/N 考虑背景的 SD;
- 误解:S/B 高掩盖了高背景漂移;
- CADD 连接:弱结合候选在低 S/B assay 中的排序不可信。
17. LLOQ / ULOQ(定量下限/上限)
校准曲线两侧保持准确度与精密度的浓度边界。
- 位置:生物分析与定量 assay;
- 关键指标:BLQ 数据的处理规则必须预先定义;
- 误解:把 LLOQ 以下记为 0——扭曲 AUC 与终末相;
- CADD 连接:PK 模型的输入数据质量边界;预测浓度低于 LLOQ 时设计采样应调整。
18. Hook effect(钩状效应/前带效应)
夹心法中分析物浓度过高导致信号反而下降。
- 位置:LBA(ELISA/MSD)高浓度样本;
- 关键指标:信号随稀释先升后降即提示;
- 误解:高剂量样本"测不出"当作阴性;
- CADD 连接:高浓度给药后的 PK 样本与高表达靶点的 total drug 检测是重灾区。
19. Orthogonality(正交性)
用原理不同的方法测量同一属性以排除方法学伪差。
- 位置:关键结论的双确认(SPR vs BLI、LBA vs LC-MS);
- 关键指标:方向一致即可,数值不必相同;
- 误解:两方法数值不一致即其一"错了"——多数时候是方法学语境不同;
- CADD 连接:计算预测本身也需"正交验证"——不同打分函数一致才可信。
20. Endpoint(终点)
实验预先定义的结果度量。
- 位置:方案设计层(主要/次要/探索性);
- 关键指标:主要终点必须在方案中预先声明(统计与监管要求);
- 误解:做完实验再挑"显著的"终点讲故事;
- CADD 连接:明确 endpoint 才能定义计算模型的训练目标。
21. Potency vs efficacy
Potency:达到效应所需的剂量(EC50 位置);efficacy:能达到的最大效应(Emax 高度)。
- 位置:药效学描述的两个独立维度;
- 关键指标:临床价值常取决于 efficacy 上限,potency 只影响剂量;
- 误解:只比较 potency——Emax 不足的候选在临床上无法通过加剂量弥补;
- CADD 连接:亲和力优化改善 potency;efficacy 由机制与表位决定。
22. Kinetic assay vs endpoint assay
动力学(时程)读数在多个时间点采集;终点法只在固定时刻读一次。
- 位置:杀伤/活化类实验设计选择;
- 关键指标:时程数据能识别快/慢机制差异;
- 误解:24 h 单点排名外推到整体药效;
- CADD 连接:机制模型的验证需要时程数据,单终点无法约束参数。
第 2 批:细胞模型与体内研究
23. CDX(细胞系来源异种移植瘤)
体外培养的肿瘤细胞系接种于免疫缺陷小鼠。
- 位置:药效初筛主力模型;
- 关键指标:接种量、生长一致性、传代历史;
- 误解:CDX 结果可预测临床——长期培养已失去患者异质性与基质;
- CADD 连接:靶点表达量在细胞系中可能与患者分布脱节,结合预测需映射真实表达谱。
24. PDX(患者来源异种移植瘤)
患者肿瘤组织直接移植,保留组织学与克隆多样性。
- 位置:转化价值更高的药效模型;
- 关键指标:代次(P0–P3 常用)、供体信息、生长速率;
- 误解:PDX=患者本人——传代漂移与鼠基质替代仍是系统性偏移;
- CADD 连接:PDX 的靶表达谱比 CDX 更接近临床分布,是检验计算外推的金标准之一。
25. Syngeneic model(同源模型)
小鼠肿瘤细胞接种于免疫健全小鼠,保留完整鼠免疫系统。
- 位置:免疫治疗机制研究(含鼠靶点交叉的分子);
- 关键指标:分子必须识别鼠靶点(cross-reactivity 前提);
- 误解:把人特异分子直接上同源模型——不结合即无药效,结论无效;
- CADD 连接:鼠/人靶点序列差异建模是同源模型选用的第一道检查。
26. Humanized mouse(免疫重建小鼠)
免疫缺陷小鼠(如 NSG)植入人造血干细胞或 PBMC,重建人免疫细胞。
- 位置:TCE/免疫激动剂的体内功能评价;
- 关键指标:重建比例与持续时间、GVHD、donor 差异;
- 误解:重建模型预测临床 CRS——重建不完全且 donor 依赖极大,只做相对比较;
- CADD 连接:靶点表达与 CD3 激活平衡的设计假设在此首次接受体内检验。
27. NSG / NOG(重度免疫缺陷品系)
NOD-scid IL2Rγnull 系小鼠,缺乏 T/B/NK 细胞。
- 位置:CDX/PDX/重建模型的宿主底盘;
- 关键指标:周龄、体重、屏障环境;
- 误解:NSG=空白画布——残余髓系与补体活性仍可产生非预期效应;
- CADD 连接:模型选择决定"机制可见性",不匹配的宿主等于盲测。
28. PBMC(外周血单个核细胞)
含 T/NK/单核/树突等的人免疫细胞混合物,功能实验的效应细胞来源。
- 位置:杀伤、细胞因子释放实验的 effector;
- 关键指标:donor 数量、活力、CD3/CD8 构成、HLA;
- 误解:单 donor 结果代表普遍人群——donor 差异可达数量级;
- CADD 连接:分子设计(CD3 arm 强度)的毒性窗口在不同 donor 上分布,需按个体数据评估。
29. E:T ratio(效靶比)
效应细胞与靶细胞的数量比。
- 位置:杀伤实验核心条件参数;
- 关键指标:必须固定并报告;梯度实验揭示依赖性;
- 误解:跨 E:T 直接比较 EC50;
- CADD 连接:效靶比改变时"最优 CD3 亲和力"随之移动——设计权衡的实验维度。
30. Serial killing(连续杀伤)
单个 T 细胞依次杀伤多个靶细胞的能力。
- 位置:长时程杀伤实验(72–96 h)观察到的现象;
- 关键指标:时程曲线的持续下降 vs 平台;
- 误解:24 h 单点杀伤代表整体活性;
- CADD 连接:低亲和 CD3 arm 的优势常在 serial killing 时程中显现。
31. Bystander effect(旁观者效应)
抗原阳性细胞被杀时,邻近抗原阴性细胞也被杀伤。
- 位置:TCE/ADC 的真实肿瘤(异质表达)药效解释;
- 关键指标:混合培养实验中阴性细胞比例的死亡;
- 误解:只测均一高表达细胞系的药效即外推临床;
- CADD 连接:旁观者能力与分子设计(如可溶性细胞因子、linker 特性)相关,是设计变量而非常数。
32. TGI(肿瘤生长抑制率)
治疗组相对对照组的肿瘤生长减少百分比。
- 位置:药效研究的主要终点候选;
- 关键指标:公式、时间点、基线定义必须一致;
- 误解:TGI=100% 即"治愈"——只是均值水平停止生长,个体可能差异巨大;
- CADD 连接:暴露—效应关系(AUC vs TGI)比单点 TGI 更接近机制模型输入。
33. T/C(治疗/对照比)
指定时间点治疗组与对照组平均体积之比。
- 位置:药效报告的历史常用指标;
- 关键指标:与 TGI 不可直接换算比较(不同公式);
- 误解:把不同报告的 TGI 与 T/C 数值直接对比;
- CADD 连接:药效数据进入定量模型前必须统一终点定义。
34. Spider plot(个体生长曲线)
每只动物肿瘤体积随时间变化的曲线组。
- 位置:药效报告的必备图;
- 关键指标:个体轨迹、退出时点、回缩是否持续;
- 误解:只报组均值±SEM 代替个体曲线;
- CADD 连接:个体差异分布是转化建模(Pop-PD)的原始素材。
35. Waterfall plot(瀑布图)
指定时间点每只动物相对基线变化量的降序排列柱图。
- 位置:药效终点可视化(常见于临床前 endpoints 与临床 RECIST);
- 关键指标:回缩深度分布、0 线与"部分缓解"阈值线;
- 误解:瀑布图好看即药效好——需结合持续性与退出原因;
- CADD 连接:响应者/非响应者分层为生物标志物分析提供输入。
36. Randomization / blinding(随机化/盲法)
按预先规则将动物分配至组别;测量者不知分组。
- 位置:研究设计层;
- 关键指标:随机化标准(如基线肿瘤体积分层);
- 误解:'笼子顺序即随机'——同笼效应成为混杂;
- CADD 连接:缺随机化的药效数据不能作为模型验证集。
37. Censoring(删失)
动物因预定规则(体积上限、溃疡、死亡)退出后,其终点数据不再观测。
- 位置:生存分析与生长曲线分析;
- 关键指标:退出原因逐只记录(informative missingness 检查);
- 误解:剔除退出动物当"未发生"——毒性导致的退出常与药效相关;
- CADD 连接:删失机制影响暴露—效应数据的可用性判断。
38. MTD(最大耐受剂量)
可接受的剂量限制毒性上限。
- 位置:毒理/药效剂量设计;
- 关键指标:物种特异;小鼠 MTD 不能外推人;
- 误解:动物 MTD×安全系数=临床剂量(简化乘法在生物药常失效,需 MABEL/NOAEL 框架);
- CADD 连接:治疗窗(MTD vs 有效暴露)决定 TPP 的 potency 目标。
39. NOAEL(未观察到有害作用剂量)
毒理研究中未见有害作用的最高剂量。
- 位置:临床起始剂量推导(ICH 指导原则);
- 关键指标:依赖物种、周期与检测敏感性;
- 误解:NOAEL=安全剂量——它是"未检出"的上界,不是保证;
- CADD 连接:候选间安全窗差异应在 nomination 前进入比较矩阵。
40. RO(受体占用率)
给药后靶点被药物占据的比例。
- 位置:PK/PD 桥接参数(Ctrough/靶点周转共同决定);
- 关键指标:占用阈值(如 ≥90%)与维持时长;
- 误解:RO 高=药效好——占用是必要非充分条件(下游激活还依赖机制);
- CADD 连接:靶点丰度与亲和力共同决定 RO 曲线,是剂量设计的核心输入。
41. TMDD(靶点介导的药物处置)
药物与靶点结合后经内吞/降解被清除,导致非线性 PK。
- 位置:抗体 PK 机制层(W14);
- 关键指标:低剂量快清除、剂量升高后清除饱和;
- 误解:把 TMDD 快清除误判为"不稳定";
- CADD 连接:亲和力越强 TMDD 清除可能越快——potency 与暴露的内在权衡。
42. FcRn(新生儿 Fc 受体)
回收 IgG、延长其半衰期的受体;pH 依赖结合。
- 位置:抗体长半衰期的分子基础;
- 关键指标:Fc 工程突变(延长/清除)选择;
- 误解:t1/2 短即分子有缺陷——先排除 TMDD/ADA/物种 FcRn 差异;
- CADD 连接:Fc/FcRn 结合界面建模是半衰期工程的设计依据。
43. ADA(抗药抗体)
机体对药物产生的免疫应答。
- 位置:PK/PD/安全性三层影响;
- 关键指标:screening 阳性率、confirmatory、titer、中和活性;
- 误解:动物 ADA 只影响动物实验——它还提示人免疫原性风险的结构因素(聚集、T 细胞表位);
- CADD 连接:去免疫设计(deimmunization)与降低聚集倾向是计算可贡献的环节。
44. Step-up dosing(阶梯给药)
首剂低剂量逐步递增以降低 CRS 风险的给药策略。
- 位置:TCE 类临床给药设计;
- 关键指标:首剂量、递增间隔与预处理方案;
- 误解:体外 CRA 低风险即无需 step-up——体外模型对临床 CRS 只有有限预测力;
- CADD 连接:CD3 arm 亲和力/价态设计决定 step-up 的幅度需求。
45. PTV(方案规定肿瘤体积)
按方案预定义公式与测量频次计算的肿瘤体积。
- 位置:药效研究的标准化度量;
- 关键指标:公式(L×W²/2 等)、测量频次、测量者间差异;
- 误解:不同实验室体积数值直接可比;
- CADD 连接:体积测量误差传播进 TGI/生长速率模型,需作为噪声项处理。
第 3 批:发现平台、CMC 与多特异分子
46. Panning(淘选)
噬菌体/酵母展示文库的多轮固相或溶液筛选。
- 位置:体外抗体发现的选择步骤;
- 关键指标:富集倍数、轮数、阴性筛选策略;
- 误解:富集好=得到好抗体——富集偏向高表达/高亲和,可能与可开发性负相关;
- CADD 连接:panning 偏差(如 scaffold 过度代表)是设计 AI 训练集时必须知道的系统性偏倚。
47. HAT 选择(杂交瘤)
含次黄嘌呤-氨基蝶呤-胸苷的培养基筛选融合细胞。
- 位置:杂交瘤流程中保留融合瘤细胞的选择压力;
- 关键指标:融合效率、克隆单克隆化验证;
- 误解:HAT 后的克隆即单克隆——需有限稀释/subcloning 验证;
- CADD 连接:无(流程术语,但影响交付克隆的序列质量)。
48. Codon optimization(密码子优化)
按宿主偏好替换同义密码子以提高表达。
- 位置:基因合成前处理;
- 关键指标:GC 含量、 motifs(剪接位点、polyA 加尾信号)规避;
- 误解:优化只影响表达量——还能引入 mRNA 结构差异影响稳定性;
- CADD 连接:与序列设计无直接冲突,但需回译确认不引入氨基酸突变。
49. Transient / stable expression(瞬转/稳转)
瞬转:质粒直接转入细胞短期表达;稳转:基因整合入宿主基因组持续表达。
- 位置:表达平台选择(W5);
- 关键指标:瞬转 titer 与稳转 cell pool/clones 滴度可不同;
- 误解:瞬转数据直接代表生产可行性;
- CADD 连接:序列特征(GC、二级结构)对两种平台影响不同,失败模式需分别归因。
50. Titer(表达滴度)
单位培养体积的产物量(mg/L)。
- 位置:表达环节核心产出指标;
- 关键指标:平台依赖(ExpiCHO vs HEK 基准不同);
- 误解:titer 低=坏序列——载体、培养工艺占比常更大;
- CADD 连接:序列可开发性预测(如 V 区疏水/电荷)对 titer 有统计可测的影响。
51. Capture / polishing(捕获/精纯)
纯化第一步(如 Protein A)与其后去除聚体/HCP 的步骤(SEC/IEX)。
- 位置:纯化工艺流程(W6);
- 关键指标:各步回收率、最终 monomer/纯度;
- 误解:capture 后"纯了"——聚体与片段需 polishing 轮数说话;
- CADD 连接:需要多轮 polishing 的候选增加 CMC 成本,进入可开发性评估。
52. SEC-HPLC(分子排阻层析)
按流体力学体积分离单体/聚体/片段的标准 QC。
- 位置:纯度与聚集评价主力;
- 关键指标:monomer %、HMW/LMW 峰;
- 误解:SEC 结果=绝对分子量分布——柱分辨与相互作用可扭曲表观比例;
- CADD 连接:高聚集倾向序列应在设计阶段由疏水性/电荷分布指标预警。
53. CE-SDS(毛细管电泳 SDS)
按分子量分离变性蛋白,评估纯度/完整性与双特异链配对。
- 位置:非还原/还原条件下的亚基分析;
- 关键指标:主峰 %、非糖基化重链(NGHC);
- 误解:CE-SDS 主峰高即样品均一——不能区分同分子量的错误配对;
- CADD 连接:多特异分子的链配对设计(见下)直接决定 CE-SDS 谱型复杂度。
54. Endotoxin(内毒素)
革兰阴性菌脂多糖,以 EU 计量;pg 级即可激活免疫细胞。
- 位置:细胞/动物实验样品的强制 QC 项;
- 关键指标:EU/mg(体外免疫实验常要求 <0.1–1);
- 误解:纯度高即内毒素低——纯度与内毒素是正交指标;
- CADD 连接:无(但误解它会让功能数据全部失效,CADD 需在数据包审阅时检查该字段)。
55. DSF / Tm(差示扫描荧光/熔解温度)
随温度升高监测去折叠,输出稳定性指标 Tm。
- 位置:可开发性快速评估;
- 关键指标:Tm1(首个转变)、Tm 裕度与制剂的关系;
- 误解:Tm 高=制剂稳定——Tm 只是必要指标之一,聚集动力学独立于 Tm;
- CADD 连接:计算稳定性预测(如 unfolding ΔG)的实验锚点之一。
56. Polyspecificity(多特异/非特异结合倾向)
抗体与无关靶点/带电聚合物的交叉反应。
- 位置:可开发性评估第一维度;
- 关键指标:BAC ELISA、PSR、HIC retention;
- 误解:只在 CDR 疏水位点出现——框架区电荷分布同样贡献;
- CADD 连接:结构表面的电荷/疏水 patch 计算是序列级预警手段。
57. Viscosity(黏度)
高浓度制剂的流动阻力,限制 SC 给药可行性。
- 位置:CMC 制剂开发;
- 关键指标:cP @ 目标浓度(SC 常需 <15–20 cP @100–200 mg/mL);
- 误解:黏度只与浓度有关——自相互作用(序列决定)主导;
- CADD 连接:电荷对称性/自相互作用预测是序列筛选维度之一。
58. Developability(可开发性)
候选以可接受成本完成放大、纯化、制剂与储运的综合可行性。
- 位置:候选选择前评估(见可开发性评估框架);
- 关键指标:五维 scorecard(非特异/聚集/化学稳定性/黏度/表达纯化);
- 误解:CMC 部门的事——序列级风险在设计时已锁定;
- CADD 连接:把可开发性指标纳入设计目标函数,是与实验决策最直接的接口。
59. KIH(Knobs-into-Holes)
重链 CH3 界面突变(一条链突出、一条链凹陷)强制异源二聚。
- 位置:双抗链配对工程技术;
- 关键指标:异源二聚体比例(常 >95% 为目标);
- 误解:KIH 完全解决配对——轻链错配与残留同源二聚仍需 common light chain 或额外工程;
- CADD 连接:界面突变设计的经典结构案例;计算稳定性检查是突变组合筛选步骤。
60. SEEDbody / CrossMab / DuoBody(双特异平台技术)
三种代表性双抗平台:SEED(链置换界面)、CrossMab(轻链交换重链界面)、DuoBody(Fab-arm exchange 体外组装)。
- 位置:多特异分子的工程实现路线(W10 平台对比);
- 关键指标:正确配对比例、纯化流程复杂度、残留同源二聚体;
- 误解:'双抗'是单一格式——平台选择改变药代、药效与 CMC 全链条;
- CADD 连接:不同平台的可用几何约束不同,直接影响"两个结合头能否同时到达"的建模假设。
61. Fab-arm exchange(Fab 臂交换)
IgG4 天然交换半分子;DuoBody 技术将其工程化为可控组装。
- 位置:双抗组装机制与 IgG4 类药物的质量关注点;
- 关键指标:体内/体外交换条件、产物异质性;
- 误解:IgG4 双抗天然稳定——需工程化铰链/Fc 突变锁定;
- CADD 连接:界面稳定性计算用于评估交换倾向。
62. 2:1 TCB(2+1 T 细胞接合器)
双靶臂 + 单 CD3 臂的三特异构型(T-cell bispecific 常用)。
- 位置:TCE 高亲和小组(如高靶密度亲和力 + 单 CD3)设计;
- 关键指标:对靶密度阴/阳细胞的选择窗、CD3 亲和力档位;
- 误解:更多结合=更强杀伤——价态升高同时推高正常组织杀伤与 CRS 风险;
- CADD 连接:几何与价态权衡是结构建模的核心应用场景。
63. DAR / payload / linker(ADC 三要素)
DAR:药物抗体比;payload:载荷毒素;linker:连接子(可裂解/不可裂解)。
- 位置:ADC 设计(W11 内化/ADC assay);
- 关键指标:DAR 分布(均一性)、linker 血浆稳定性、bystander 能力;
- 误解:DAR 越高越好——清除加速与毒性窗口收窄;
- CADD 连接:linker/位点选择(工程化半胱氨酸/酶切位点)与毒性预测均可计算辅助。
64. HIC(疏水相互作用层析)
按表面疏水性分离分子/异构体。
- 位置:ADC DAR 组分分离与可开发性评估;
- 关键指标:保留时间与 polyspecificity 相关性;
- 误解:HIC 只是纯化工具——保留时间是疏水表面 patch 的可开发性探针;
- CADD 连接:表面疏水 patch 计算与 HIC 保留时间的关联是序列级预警。
待补充关键词
| 日期 | 关键词 | 出现场景 | 优先级 | 状态 |
|---|---|---|---|---|
| 2026-08-06 | plasmid/质粒 | 抗体表达 | 高 | 已补 |
| 2026-08-06 | CRS | TCE 安全性 | 高 | 已补 |
| 2026-08-06 | hybridoma/杂交瘤 | 抗体发现 | 中 | 已补 |
| 2026-08-06 | phage display library/噬菌体库 | 抗体发现 | 高 | 已补 |
| 2026-08-06 | single-cell sequencing/单细胞测序 | 单 B 平台 | 高 | 已补 |
| 2026-08-19 | 第 1 批 assay 与读数语言(§6–§22) | 通用 | 高 | 已补 |
| 2026-08-19 | 第 2 批 细胞与体内模型(§23–§45) | 通用 | 高 | 已补 |
| 2026-08-19 | 第 3 批 发现/CMC/多特异平台(§46–§64) | 通用 | 高 | 已补 |
| 待补 |